Principaux messages
- Il existe des données probantes limitées sur la capacité des LC-mNAAT à identifier correctement la tuberculose pulmonaire chez les enfants.
- D'autres études sont nécessaires pour évaluer la précision des LC-mNAAT chez les enfants.
Pourquoi est-il important d'améliorer le diagnostic de la tuberculose pulmonaire chez les enfants ?
La tuberculose chez les enfants est souvent sous-détectée en raison des difficultés à diagnostiquer la maladie. La détection et le traitement précoces de la tuberculose chez les enfants sont essentiels pour garantir une guérison rapide et efficace. Cependant, il est difficile de détecter la tuberculose à un stade précoce en raison de la diversité de ses formes et de ses symptômes, ainsi que des difficultés à produire des expectorations (mucus provenant des poumons). En outre, la charge bacillaire présente dans les échantillons est plus faible que chez les adultes. Les faux positifs peuvent provoquer une anxiété inutile, et un suivi des enfants, monopolisant du temps et des ressources. Ces enfants peuvent également commencer un traitement contre la tuberculose avec des effets secondaires graves. Les faux négatifs peuvent empêcher la détection de cas, favorisant ainsi la propagation de la maladie. Les enfants présentant de faux négatifs peuvent également développer des formes graves de tuberculose, entraînant la mort en raison d'un diagnostic tardif.
Quels sont les tests manuels d'amplification des acides nucléiques de faible complexité utile à la détection de la tuberculose ?
L'un des tests employés pour diagnostiquer la tuberculose est le TB-LAMP (loop-mediated isothermal amplification, ou amplification isotherme médiée par boucles), qui fait partie d’une catégorie de tests manuels d'amplification des acides nucléiques de faible complexité (LC-mNAAT). Ces tests peuvent être utilisés dans des endroits avec des infrastructures relativement simples, comme celles nécessaires à l'examen microscopique des expectorations (examen au microscope du mucus provenant des poumons). Ils sont plus précis que les tests effectués à partir d'expectorations ou d'autres échantillons respiratoires, même lorsque la charge bactérienne est faible, et donnent des résultats en quelques heures. À l'heure actuelle, on manque de données probantes sur la précision du test TB-LAMP dans la détection de la tuberculose chez les enfants.
Qu’avons-nous cherché à découvrir ?
Nous avons voulu savoir la précision des LC-mNAAT pour détecter la tuberculose pulmonaire chez les enfants présumés atteints, et la comparer à celle du Xpert MTB/RIF Ultra et de l’examen microscopique direct des frottis.
Comment avons-nous procédé ?
Nous avons recherché des études portant sur la précision des LC-mNAAT dans la détection de la tuberculose pulmonaire chez les enfants et examiné les résultats des études pertinentes.
Qu’avons-nous trouvé ?
Nous avons inclus quatre études (303 participants, 25 enfants atteints de tuberculose) qui ont évalué le TB-LAMP. Une étude a comparé la précision du TB-LAMP et du Xpert MTB/RIF Ultra, et trois études ont également utilisé l’examen microscopique direct des frottis. Ces études ont utilisé plusieurs échantillons respiratoires et non respiratoires pour détecter la tuberculose. Toutes les études ont utilisé la culture comme norme de référence, c’est-à-dire le meilleur moyen disponible pour détecter la tuberculose.
Échantillons respiratoires
Trois études (67 enfants, parmi eux, huit testés positifs à la tuberculose) ont utilisé des échantillons respiratoires, comme les expectorations, le lavage broncho-alvéolaire (liquide obtenu après lavage des voies respiratoires et des poumons) et l’aspiration trachéale (liquide provenant de la trachée). Les résultats indiquent que 60 à 100 % des enfants atteints de tuberculose seront identifiés comme positifs par le test TB-LAMP, et que 95 à 100 % des enfants non atteints de tuberculose seront identifiés comme négatifs par le test.
Aspiration gastrique (liquide prélevé dans l'estomac à l'aide d'un tube)
Trois études ont utilisé des échantillons de tubage gastrique (176 enfants, parmi eux, 14 testés positifs à la tuberculose pulmonaire). Les résultats indiquent que 64 % des enfants atteints de tuberculose seront identifiés comme positifs par le test TB-LAMP, et que 35 à 87 % des enfants non atteints de tuberculose seront identifiés comme négatifs par le test.
Tubage gastrique (liquide prélevé dans l'estomac à l'aide d'un tube après un lavage)
Une étude portant sur 60 enfants (dont trois testés positifs à la tuberculose) a évalué le tubage gastrique. Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture, 135 seraient testés positifs au TB-LAMP, parmi eux, 99 auraient la tuberculose et 36 non ; 865 seraient testés négatifs au TB-LAMP, parmi eux, 864 n'auraient pas la tuberculose et un si.
Aspiration nasopharyngée (liquide prélevé au fond du nez et de la gorge)
Une étude (144 enfants, dont 12 testés positifs à la tuberculose) a évalué l'aspiration nasopharyngée. Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture, 71 seraient positifs au TB-LAMP, parmi eux, 12 auraient la tuberculose et 59 non ; 929 seraient testés négatifs, parmi eux, 921 n'auraient pas la tuberculose et 8 si.
Selles
Une étude a évalué des échantillons de selles (144 enfants, dont sept testés positifs à la tuberculose pulmonaire). Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture, 171 seront testés positifs au TB-LAMP, parmi eux, 99 auront la tuberculose et 72 non ; 829 seront testés négatifs, parmi eux, 828 n'auront pas la tuberculose, et un enfant l’aura.
Quelles sont les limites des données probantes ?
Nous n'avons trouvé aucune étude utilisant une standard de référence composite (les résultats de différents tests sont combinés et considérés comme un test de confirmation). La culture n'étant pas le meilleur moyen de détecter la maladie chez l'enfant, nos données probantes sont limitées. Les résultats proviennent de quatre études portant sur un petit nombre d'enfants, et les conclusions sont susceptibles d'évoluer quand d'autres études seront disponibles.
Dans quelle mesure ces données probantes sont-elles à jour ?
Les données probantes sont à jour jusqu'en octobre 2023.
Lire le résumé complet
Le diagnostic précis et rapide de la tuberculose chez l’enfant est difficile en raison de symptômes cliniques non spécifiques et de la faible charge bacillaire des échantillons. Les tests manuels d’amplification des acides nucléiques à faible complexité (LC-mNAAT), tels que l’amplification isotherme médiée par boucles (TB-LAMP), sont des tests de détection moléculaire rapide recommandés par l’Organisation mondiale de la santé (OMS). Même dans des environnements où les ressources sont limitées, ces tests présentent une exactitude diagnostique élevée chez l’adulte.
Objectifs
Déterminer l’exactitude diagnostique des LC-mNAAT pour la détection de la tuberculose pulmonaire chez les enfants de moins de 10 ans suspectés de tuberculose pulmonaire.
Objectifs secondaires
1. Comparer les exactitudes diagnostiques des LC-mNAAT et du test Xpert MTB/RIF Ultra pour détecter la tuberculose pulmonaire chez l’enfant suspecté de tuberculose pulmonaire.
2. Comparer les exactitudes diagnostiques des LC-mNAAT et de l’examen microscopique direct des frottis pour détecter la tuberculose pulmonaire chez l’enfant, dans le cadre d’une utilisation du TB-LAMP en tant que test de remplacement.
3. Déterminer l’exactitude diagnostique des LC-mNAAT pour détecter la tuberculose pulmonaire, s'ils sont utilisés comme test complémentaire chez les enfants dont le frottis d'expectoration est négatif.
4. Étudier les sources potentielles d'hétérogénéité dans la précision diagnostique des LC-mNAAT en raison de facteurs tels que l’état du frottis, l'âge, la séropositivité, l’environnement et l’incidence de la tuberculose.
Stratégie de recherche documentaire
Nous avons effectué des recherches dans les bases de données CENTRAL, MEDLINE, Embase, Science Citation Index, Biosis Previews, Global Index Medicus, SCOPUS, la Plateforme internationale de registres d'essais cliniques (ICTRP) de l’OMS et le site ClinicalTrials.gov le 2 octobre 2023 pour trouver des articles publiés et des essais en cours quelles que soient la langue ou la date. Nous avons examiné les références bibliographiques des articles inclus, des résumés de conférences, des revues sur la tuberculose et des recommandations. Pour identifier les thèses, nous avons effectué des recherches dans les bases de données ProQuest Dissertations & Theses A&I. Nous avons pris contact avec Stop TB Partnership, l’ONG FIND et d'autres experts de la tuberculose pour obtenir des études en cours et qui ne sont pas encore publiées. Un appel public de l'OMS a été lancé entre le 30 novembre 2023 et le 15 février 2024 pour obtenir des études en cours et non publiées de la part de fabricants et de chercheurs.
Critères de sélection
Nous avons inclus des études transversales et de cohorte qui ont évalué les LC-mNAAT chez les enfants (< 10 ans) par rapport à des normes de référence microbiologiques ou composites. Notre test index était le TB-LAMP, et les tests index de comparaison étaient le Xpert MTB/RIF Ultra et l’examen microscopique direct des frottis. La norme de référence microbiologique comprenait la culture en milieu liquide automatisée, la culture en milieu solide ou une combinaison des deux méthodes. Nous avons pris uniquement en compte les technologies commercialisées et dont la conception a été validée.
Recueil et analyse des données
Quatre auteurs de revue, en binôme, ont indépendamment examiné les titres et les résumés et ont évalué tous les contenus des articles potentiellement éligibles. Un cinquième auteur de la revue a résolu les désaccords éventuels. Nous avons adapté et utilisé les outils QUADAS-2 et QUADAS-C pour évaluer le risque de biais et l'applicabilité. Six auteurs de revues, répartis en trois binômes, ont extrait les données et procédé à l'évaluation de la qualité méthodologique. Un septième auteur de revue a résolu les désaccords éventuels. Nous avons contacté les auteurs des études primaires pour obtenir les données manquantes. Nous avons évalué le niveau de confiance des données probantes à l'aide de l'outil en ligne GRADEpro GDT.
Résultats principaux
Nous avons inclus quatre études éligibles (303 participants). Trois études ont été menées dans des pays à revenu faible ou intermédiaire, et deux dans des pays où la charge de morbidité de la tuberculose est élevée. Les quatre études ont évalué différents types d'échantillons respiratoires et non respiratoires, ainsi que le test TB-LAMP par rapport à la norme de référence microbiologique.
Nous avons jugé qu'une étude présentait un risque de biais incertain dans deux domaines de l’échelle QUADAS-2. Le risque de biais était faible pour la plupart des études. Une étude a recruté des patients hospitalisés dans des établissements de niveau 3, ce qui a soulevé des problèmes d'applicabilité.
Trois études (67 enfants, dont huit atteints de tuberculose pulmonaire) ont évalué des échantillons respiratoires (expectoration, lavage broncho-alvéolaire et aspiration trachéale). Les sensibilités étaient comprises entre 60 et 100 %, et les spécificités entre 95 et 100 % (données probantes d'un niveau de confiance très faible pour la sensibilité et faible pour la spécificité). Trois études (176 participants, dont 14 enfants atteints de tuberculose pulmonaire) ont eu recours à l'aspiration gastrique ; la sensibilité n'a pas pu être estimée dans deux études, et était de 64 % dans la troisième. Les spécificités étaient comprises entre 93 et 100 %. La sensibilité était de 100 % (intervalle de confiance (IC) à 95 % de 29 à 100) et la spécificité de 96 % (IC à 95 % de 88 à 100) pour le liquide de lavage gastrique d'une étude. Une étude (144 participants, dont 12 enfants atteints de tuberculose pulmonaire) a évalué la précision du diagnostic en utilisant l'aspiration nasopharyngée. La sensibilité était de 58 % (IC à 95 % de 28 à 85) et la spécificité de 94 % (IC à 95 % de 88 à 97). La même étude (sept enfants atteints de tuberculose pulmonaire) a également évalué des échantillons de selles, et la sensibilité et la spécificité étaient respectivement de 100 % (IC à 95 % de 59 à 100) et de 92 % (IC à 95 % de 86 à 96). Nous n'avons pas réalisé de méta-analyse en raison du nombre limité de données.
Interprétation des résultats
Échantillons respiratoires
Sur 1 000 enfants testés, si 100 d'entre eux sont atteints de tuberculose d'après les résultats de la culture, 60 à 100 enfants atteints de tuberculose seront identifiés comme positifs par le TB-LAMP. Sur les 900 enfants non tuberculeux, 855 à 900 seraient identifiés comme négatifs par le test.
Aspiration gastrique
Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture,64 d’entre eux seraient identifiés comme positifs par le TB-LAMP. Sur les 900 enfants non tuberculeux, 837 à 900 seraient identifiés comme négatifs par le test.
Tubage gastrique
Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose selon les résultats de la culture, 135 seront positifs au TB-LAMP, parmi eux, 100 auront la tuberculose (vrais positifs) et 35 n'auront pas la tuberculose (faux positifs) ; 865 seront négatifs au TB-LAMP, parmi eux, 864 n'auront pas la tuberculose (vrais négatifs) et un aura la tuberculose (faux négatifs).
Aspiration nasopharyngée
Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture, 112 seront positifs au TB-LAMP, parmi eux, 58 auront la tuberculose (vrais positifs) et 54 n'auront pas la tuberculose (faux positifs) ; 888 seront négatifs, parmi eux, 846 n'auront pas la tuberculose (vrais négatifs) et 42 auront la tuberculose (faux négatifs).
Selles
Sur 1 000 enfants testés, si 100 ont la tuberculose d'après les résultats de la culture, 171 seront positifs au TB-LAMP, parmi eux, 99 auront la tuberculose (vrais positifs) et 72 n'auront pas la tuberculose (faux positifs) ; 829 seront négatifs, parmi eux, 828 n'auront pas la tuberculose (vrais négatifs) et un enfant aura la tuberculose (faux négatif).
Conclusions des auteurs
Les données probantes sur la précision diagnostique des LC-mNAAT (tests manuels d’amplification des acides nucléiques à faible complexité) pour la détection de la tuberculose pulmonaire chez les enfants sont limitées en raison d'études peu nombreuses et de petite envergure. Des études de puissance statistique suffisante qui évaluent les LC-mNAAT chez les enfants sont nécessaires.
Traduction et Post-édition réalisées par Cochrane France avec le soutien de Florie Dessalle, Lydia Rahali (bénévoles chez Cochrane France) et grâce au financement du Ministère de la Santé. Une erreur de traduction ou dans le texte original ? Merci d’adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr
