Principaux messages
- L'utilisation d'échantillons respiratoires et de selles pour des tests automatisés peu complexes (LC-aNAATs) a permis d'augmenter le nombre de cas de tuberculose pulmonaire détectés chez les enfants (séropositifs au VIH ou non).
- L'ajout du test de lipoarabinomannane urinaire à flux latéral (LF-LAM) a permis d'identifier des cas supplémentaires de tuberculose pulmonaire chez les enfants séropositifs au VIH (virus de l'immunodéficience humaine).
- Les tests parallèles peuvent conduire à un plus grand nombre de diagnostics erronés chez des enfants n'ayant pas la tuberculose (faux positifs), et cet effet indésirable est probablement plus prononcé dans les contextes où la tuberculose est moins fréquente.
Pourquoi est-il difficile de diagnostiquer la tuberculose pulmonaire chez les enfants ?
Les enfants avec une tuberculose au poumon (tuberculose pulmonaire) ont des symptômes non spécifiques qui rendent le diagnostic difficile. L'approche standard du diagnostic de la tuberculose pulmonaire consiste à détecter la bactérie ( Mycobacterium tuberculosis ) dans les poumons en recueillant des expectorations. Cependant, les enfants sont souvent incapables de cracher des expectorations et nécessitent des procédures plus compliquées pour obtenir un échantillon respiratoire. De plus, les enfants ont un petit nombre de bactéries dans leurs expectorations comparé aux adultes, ce qui rend les tests moins utiles que chez les adultes. C'est particulièrement vrai pour les enfants séropositifs au VIH.
Que sont les tests parallèles ?
Les tests parallèles consistent à utiliser plusieurs tests en même temps. Cela peut signifier l'utilisation de deux tests ou plus, ou de deux types d'échantillons ou plus avec le même test. Un résultat positif aux tests parallèles signifie que n'importe lequel des tests a donné un résultat positif. Nous avons étudié des tests parallèles utilisant des LC-aNAATs à la fois sur des échantillons respiratoires et de selles pour détecter la bactérie de la tuberculose. Pour les enfants séropositifs au VIH, nous avons également étudié l'effet de l'ajout d'un test urinaire de dépistage de la tuberculose (LF-LAM).
Que voulions‐nous savoir ?
Nous voulions déterminer :
- la précision des tests parallèles de détection de la tuberculose pulmonaire chez les enfants ; et
- si les tests parallèles augmentent la précision de la détection de la tuberculose pulmonaire infantile par rapport à un test unique.
Comment avons-nous procédé ?
Nous avons recherché des études ayant effectué ces tests multiples chez des enfants testés pour la tuberculose pulmonaire. Nous avons combiné les résultats de ces études et examiné la précision de ces tests lorsqu'ils sont utilisés seuls et en parallèle. Nous avons ensuite déterminé si les tests parallèles permettaient d'identifier plus de cas de tuberculose chez les enfants qu'un seul test. Nous avons également déterminé si les tests parallèles conduisaient à ce que davantage d'enfants non tuberculeux soient diagnostiqués à tort comme ayant la tuberculose.
Qu’avons-nous trouvé ?
Dans l'ensemble, nous avons examiné les résultats de 14 études, dont six portaient sur des enfants séropositifs au VIH. Les enfants participant aux études provenaient de 14 pays différents où la tuberculose est fréquente.
Principaux résultats
Enfants séronégatifs au VIH ou avec un statut sérologique inconnu
Dans une population théorique de 1 000 enfants séronégatifs au VIH, dont 100 enfants sont atteints de tuberculose pulmonaire, l'utilisation parallèle de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles permettrait de diagnostiquer 7 enfants supplémentaires atteints de tuberculose, par rapport à l'utilisation de LC-aNAATs uniquement sur un échantillon respiratoire. Cependant, 16 enfants non tuberculeux de plus seront diagnostiqués à tort comme ayant la tuberculose.
Comparé à l'utilisation du LC-aNAATs uniquement sur les selles, les tests parallèles de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles permettra d'identifier 22 enfants tuberculeux de plus, mais de diagnostiquer à tort 37 enfants non tuberculeux de plus.
Enfants séropositifs au VIH
Dans une population théorique de 1 000 enfants séropositifs, où 400 enfants sont atteints de tuberculose pulmonaire, l'utilisation parallèle de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles permettrait de diagnostiquer 16 enfants de plus, par rapport à l'utilisation d'un seul LC-aNAATs sur un échantillon respiratoire, mais entraînerait un diagnostic erroné chez 11 enfants supplémentaires non atteints de tuberculose.
Comparativement à l'utilisation du LC-aNAATs uniquement sur les selles, les tests parallèles de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles permettrait d'identifier 34 enfants tuberculeux de plus, mais de diagnostiquer à tort neuf enfants non tuberculeux de plus.
Si l'on ajoutait le test LF-LAM à l'utilisation parallèle de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles, on diagnostiquerait correctement 28 enfants tuberculeux de plus que si l'on effectuait uniquement le LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles, mais on diagnostiquerait également de manière erronée 61 enfants non tuberculeux.
Prévalence de la tuberculose (fréquence dans la population)
Pour les enfants séropositifs et séronégatifs au VIH, si moins d'enfants dans la population sont atteints de tuberculose, les tests parallèles permettraient de diagnostiquer moins d'enfants tuberculeux, tout en diagnostiquant à tort plus d'enfants non tuberculeux.
Quelles sont les limites des données probantes ?
Bien que nous ayons pu inclure un grand nombre d'enfants provenant de milieux différents, nous n'avons pas pu inclure les données de certaines études existantes. Il est difficile de diagnostiquer la tuberculose pulmonaire chez les enfants, même avec le test de référence, ce qui réduit notre confiance dans le fait que les tests parallèles aient mal diagnostiqué les enfants atteints de tuberculose. En raison de ces limites, notre confiance dans les données probantes est généralement faible à modérée.
Ces données probantes sont-elles à jour ?
Les données probantes sont basées sur les recherches effectuées jusqu'au 3 novembre 2023.
Lire le résumé complet
Les tests d'amplification de l'acide nucléique automatisés à faible complexité (LC-aNAATs, pour low‐complexity automated nucleic acid amplification tests) sont des tests moléculaires largement utilisés pour diagnostiquer la tuberculose chez les enfants. Le test urinaire à flux latéral pour la détection du lipoarabinomannane (LF-LAM, pour lateral flow urine lipoarabinomannan assay) est recommandé pour les enfants séropositifs au VIH (virus de l'immunodéficience humaine). Les revues systématiques précédentes ont évalué la précision diagnostique des LC-aNAATs et du LF-LAM séparément chez les enfants, mais dans la pratique clinique, les tests peuvent être utilisés simultanément, c'est-à-dire en « parallèle ».
Objectifs
Comparer la précision diagnostique de l'utilisation parallèle de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et selles d’enfants, et du LF-LAM sur des échantillons urinaires d’enfants vivant avec le VIH par rapport à chaque test seul pour la détection de la tuberculose pulmonaire.
Stratégie de recherche documentaire
Nous avons effectué des recherches dans MEDLINE, Embase, Science Citation Index-Expanded, Conference Proceedings Citation Index - Science, Biosis Previews, le Registre Cochrane Central des Essais Contrôlés, Scopus, OMS (Organisation mondiale de la Santé) Index Medicus Global , ClinicalTrials.gov et la Plateforme internationale de registres d'essais cliniques de l'OMS jusqu'au 3 novembre 2023. L'OMS a lancé un appel public pour obtenir des données sur la précision de LC-aNAATs et du LF-LAM chez les enfants jusqu'en décembre 2023.
Critères de sélection
Nous avons inclus les études qui recrutaient des enfants de moins de 10 ans avec suspicion de tuberculose pulmonaire, et fournissaient des données permettant d'évaluer la précision des tests parallèles et d’au moins un des tests composants, par rapport à un standard de référence microbiologique (MRS, pour microbiological reference standard) basé sur la culture ou un standard de référence composite (CRS, pour culture or composite reference standard) incluant le diagnostic clinique.
Recueil et analyse des données
Nous avons extrait les données à l'aide d'un formulaire standardisé et évalué la qualité des études à l'aide des outils QUADAS-2 et QUADAS-C. Nous avons réalisé une méta-analyse bivariée à effets aléatoires selon une approche bayésienne afin d’estimer la sensibilité, la spécificité et les différences absolues entre les tests index. Les estimations de la précision diagnostique ont été calculées principalement par rapport au MRS et secondairement par rapport au CRS. Nous avons utilisé GRADE pour évaluer le niveau de confiance de données probantes pour la comparaison de la précision diagnostique.
Résultats principaux
Nous avons inclus 14 études pour évaluer les tests parallèles chez les enfants séropositifs et séronégatifs au VIH. De plus, six des 14 études ont été incluses pour évaluer les LC-aNAATs avec le LF-LAM chez les enfants séropositifs au VIH. Hormis un risque de biais élevé avec le CRS en raison de l'incorporation potentielle des résultats du test index dans les diagnostics cliniques, les études présentaient généralement un faible risque de biais dans l’ensemble des domaines du QUADAS-2 et du QUADAS-C.
Utilisation parallèle des LC-aNAATs respiratoires et de selles
Enfants séronégatifs au VIH ou avec un statut sérologique inconnu
Nous avons inclus huit études (2 145 participants, prévalence de la tuberculose 8,1% (173/2145)) pour l'évaluation par rapport au MRS. L'utilisation parallèle de LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles a eu une sensibilité combinée estimée à 79,9 % (intervalle de crédibilité (ICr) à 95 % de 67,9 à 89,8) et une spécificité combinée estimée à 93,4 % (ICr à 95 % de 87,2 à 97,0). Comparé au LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires seuls, les tests parallèles avaient une sensibilité supérieure de 7,1 (ICr à 95 % : 3,2 à 13,4) points de pourcentage et un changement de spécificité de -1,7 (ICr à 95 % : -3,8 à -0,6) point de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance faible dans les deux cas). Comparé au LC-aNAATs sur les selles seules, les tests parallèles avaient une sensibilité supérieure de 22,1 (ICr à 95 % : 13,7 à 32,7) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance modéré) et une différence de spécificité de -4,1 (ICr à 95 % : -8,0 à -1,7) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance faible).
Enfants séropositifs au VIH
Par rapport au MRS (sept études, 697 participants, prévalence de la tuberculose 6,3 % (44/697)), l'utilisation parallèle du LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles avait une sensibilité combinée estimée à 70,2 % (ICr à 95 % 51,1 à 84,7) et une spécificité de 95,4 % (ICr à 95 % 91,7 à 97,8). Comparé au LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires seuls, les tests parallèles présentaient une sensibilité supérieure de 4,0 (ICr à 95 % : 0,6 à 12,9) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance modéré) et une différence de spécificité de -1,9 (ICr à 95 % : -3,9 à -0,7) point de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance modéré). Comparé au LC-aNAATs sur les selles seules, les tests parallèles présentaient une sensibilité supérieure de 8,5 (ICR à 95 % : 2,4 à 20,9) points de pourcentage et une différence de spécificité de -1,4 ICr à 95 % : -3,3 à -0,4) point de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance modéré dans les deux cas).
Standard de référence composite
L'utilisation parallèle des LC-aNAATs respiratoires et de selles a eu une sensibilité plus faible que le CRS chez les enfants séropositifs et séronégatifs au VIH, avec des différences plus faibles par rapport à l'utilisation de chaque test seul (données probantes d’un niveau de confiance faible pour les enfants séronégatifs et d’un niveau de confiance faible pour les enfants séropositifs). La spécificité des tests parallèles était similaire entre le MRS et le CRS.
Utilisation parallèle de LC-aNAATs respiratoires et de selles et de LF-LAM chez les enfants séropositifs au VIH
Nous avons inclus six études pour l'évaluation de la précision diagnostique par rapport au MRS (653 participants, prévalence de la tuberculose 6,6 % (43/653)). L'utilisation parallèle du LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles et du LF-LAM a eu une sensibilité combinée estimée à 77,6 % (ICr à 95 % 60,0 à 89,6) et une spécificité combinée estimée à 83,9 % (ICr à 95 % 73,9 à 90,4). Comparé au LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles, les tests parallèles présentaient une sensibilité supérieure de 6,9 (ICr à 95 % : 1,5 à 20,1) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance faible) et une différence de spécificité de -10,2 (ICr à 95 % : -19,6 à -4,9) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance modéré).
Standard de référence composite
Comparé au CRS (six études, 674 participants, prévalence de la tuberculose 42,4 % (286/674)), l'utilisation parallèle du LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles et du LF-LAM avait une sensibilité combinée de 30,0 % (ICr à 95 % : 13,2 à 54,8) et une spécificité de 83,3 % (ICr à 95 % : 69,8 à 90,2). Comparé au LC-aNAATs sur des échantillons respiratoires et de selles, les tests parallèles présentaient une sensibilité supérieure de 11,5 (ICr à 95 % : 3,8 à 26,7) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance très faible) et une différence de spécificité de -10,1 (ICr à 95 % : -21,6 à -4,9) points de pourcentage (données probantes d’un niveau de confiance faible).
Conclusions des auteurs
L'utilisation de tests d'amplification de l'acide nucléique automatisés à faible complexité (LC-aNAATs) sur des échantillons respiratoires et de selles pourrait augmenter la sensibilité des tests de diagnostic de la tuberculose chez les enfants, y compris ceux séropositifs au VIH (virus de l'immunodéficience humaine), et l'ajout du test urinaire à flux latéral pour la détection du lipoarabinomannane (LF-LAM) pour les enfants séropositifs au VIH pourrait davantage augmenter la sensibilité, bien qu'au prix d'une réduction de la spécificité. Les tests de selles et d'urine ne sont pas invasifs et pourraient compléter les tests d'échantillons respiratoires pour augmenter la détection des cas de tuberculose chez les enfants. Les bénéfices des tests parallèles pourraient être plus importants dans les contextes avec une forte prévalence de la tuberculose, bien qu’il pourrait y avoir une plus grande proportion de faux-positifs et un risque plus important de surtraitement dans les régions avec une faible prévalence de la tuberculose.
Financement
École de Médecine Tropicale de Liverpool; Ministère des Affaires Étrangères, du Commonwealth et du Développement (en anglais : Foreign, Commonwealth and Development Office, FCDO) ; OMS, Prévention, diagnostic, traitement, soins et innovation en matière de tuberculose (en anglais : TB Prevention, Diagnosis, Treatment, Care & Innovation, PCI), Programme mondial de lutte contre la tuberculose
Enregistrement
Protocole disponible via https://doi.org/10.1002/14651858.CD016071 , version publiée le 13 mai 2024.
Traduction et Post-édition réalisées par Cochrane France avec le soutien de Joseline Zafack (bénévole chez Cochrane France) et grâce au financement du Ministère de la Santé. Une erreur de traduction ou dans le texte original ? Merci d’adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr
