principaux messages
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Xpert Ultra a une sensibilité (personnes atteintes de tuberculose correctement diagnostiquées comme ayant la maladie) et une spécificité (personnes non atteintes de tuberculose correctement identifiées comme n'ayant pas la maladie) élevées pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire chez les personnes suspectées de tuberculose sur la base de signes, de symptômes ou d'une radiographie thoracique anormale.
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Xpert Ultra présente une sensibilité (personnes présentant une résistance à la rifampicine correctement diagnostiquées comme présentant la résistance) et une spécificité (personnes ne présentant pas de résistance à la rifampicine correctement identifiées comme ne présentant pas la résistance) élevées dans la détection de la résistance à la rifampicine (un traitement important de la tuberculose).
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Xpert Ultra présente une sensibilité réduite chez les personnes dont le frottis d'expectoration est négatif (le mucus craché par les voies respiratoires est examiné au microscope et les bactéries de la tuberculose ne sont pas vues) et une spécificité réduite chez les personnes avec des antécédents de tuberculose.
Pourquoi est-il important d'améliorer le diagnostic de la tuberculose pulmonaire ?
La tuberculose pulmonaire est une maladie des poumons causée par une bactérie (un germe) qui se propage dans l'air via les gouttelettes d'une personne infectée. Pendant les premiers stades, il reste dormant (il ne se multiplie pas) et le patient présente des symptômes tels que fièvre, toux, perte de poids et sueurs nocturnes. La tuberculose est l'une des principales causes de décès dans le monde. Lorsque les personnes reçoivent un traitement approprié et opportun, la tuberculose est généralement guérissable. L'un des problèmes liés à la gestion de la tuberculose est que la bactérie devient résistante à la rifampicine (un antibiotique), ce qui signifie que ce médicament n'est plus efficace. La lutte contre la tuberculose est menacée par les retards de diagnostic et les traitements inappropriés lorsque les personnes ont une résistance à la rifampicine. Les personnes vivant avec le VIH ont un risque plus accru de développer une tuberculose.
Qu'est-ce que le test Xpert Ultra ?
Xpert Ultra est recommandé par l'Organisation mondiale de la Santé (une organisation internationale de renom axée sur la santé mondiale) comme test rapide permettant de détecter simultanément la tuberculose et la résistance à la rifampicine.
Que voulions‐nous savoir ?
Nous avons voulu déterminer la précision de Xpert Ultra pour diagnostiquer la tuberculose pulmonaire et la résistance à la rifampicine chez les adultes (âgés de 15 ans et plus) et les adolescents (âgés de 10 à 14 ans).
Comment avons-nous procédé ?
Nous avons recherché des études portant sur la précision du Xpert Ultra dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire et de la résistance à la rifampicine.
Qu’avons-nous trouvé ?
Nous avons trouvé 32 études (12 529 personnes) qui ont évalué Xpert Ultra pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire, et 10 études (1 644 personnes) qui ont évalué Xpert Ultra pour la résistance à la rifampicine.
Pour la détection de la tuberculose, Xpert Ultra avait :
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une sensibilité élevée (91 personnes sur 100 atteintes de tuberculose ont été correctement diagnostiquées comme telles ; Xpert Ultra a manqué 9 cas) ;
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une spécificité élevée (95 personnes sur 100 ne souffrant pas de tuberculose ont été correctement identifiées comme non atteintes de cette maladie ; Xpert Ultra a manqué 5 cas).
La sensibilité du Xpert Ultra était plus faible chez les personnes dont le frottis d'expectoration était négatif (mucus expectoré des voies respiratoires négatif pour la tuberculose) et la spécificité était plus faible chez les personnes avec des antécédents de tuberculose.
Pour la détection de la résistance à la rifampicine, le Xpert Ultra avait :
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une sensibilité élevée (96 personnes sur 100 présentant une résistance à la rifampicine ont été correctement diagnostiquées comme ayant une résistance ; Xpert Ultra a manqué 4 cas) ;
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une spécificité élevée (98 personnes sur 100 sans résistance à la rifampicine ont été correctement identifiées comme n'ayant pas de résistance ; Xpert Ultra a manqué 2 cas).
Quelles sont les limites des données probantes ?
Six des 32 études qui ont détecté la tuberculose et trois des 10 études qui ont détecté la résistance à la rifampicine ont été menées dans des hôpitaux spécialisés, de ce fait ces résultats peuvent ne pas s'appliquer aux personnes travaillant en cabinet et dans des hôpitaux locaux.
Les résultats concernant la détection de la tuberculose chez les adolescents par Xpert Ultra reposent sur six études portant sur seulement 160 adolescents, ce qui limite nos conclusions.
Nous n'avons pas été en mesure d'estimer la précision du Xpert Ultra pour les tests de résistance à la rifampicine chez les personnes vivant avec le VIH, car nous n'avons trouvé aucune étude.
Ces données probantes sont-elles à jour ?
Cette revue est basée sur une recherche de base de données effectuée le 16 octobre 2023. Ces résultats ont été complétés par ceux d'un appel publique de l'Organisation mondiale de la Santé portant sur les études en cours et non publiées entre le 30 novembre 2023 et le 15 février 2024. Nous avons également contacté des experts travaillant sur de nouveaux diagnostics de la tuberculose.
Lire le résumé complet
Le Xpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra) est un test moléculaire de diagnostic rapide recommandé par l'Organisation mondiale de la Santé (OMS) qui détecte simultanément la tuberculose et la résistance à la rifampicine. Cette revue met à jour une revue Cochrane comparative de Xpert MTB/RIF et de Xpert Ultra, ce dernier ayant remplacé le Xpert MTB/RIF.
Objectifs
Déterminer la précision diagnostique de Xpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra) pour la détection de la tuberculose pulmonaire et de la résistance à la rifampicine chez les adultes et les adolescents présentant une tuberculose présumée sur la base de signes ou symptômes, ou d’une radiographie thoracique anormale évocatrice de tuberculose.
Stratégie de recherche documentaire
Nous avons effectué des recherches dans sept bases de données, notamment CENTRAL, MEDLINE et Embase, ainsi que dans deux registres d'essais (ClinicalTrials.gov et l'ICTRP de l'OMS) jusqu'au 16 octobre 2023, sans restriction sur la langue. Un appel publique de l'OMS pour les études en cours et non publiées a été lancé entre le 30 novembre 2023 et le 15 février 2024.
Critères de sélection
Nous avons inclus des études transversales, des études de cohorte et des essais contrôlés randomisés qui fournissaient des données sur la précision diagnostique de Xpert Ultra à partir d'échantillons respiratoires chez des adolescents (âgés de 10 à 14 ans) et des adultes (âgés de 15 ans et plus) atteints d’une tuberculose pulmonaire présumée. Pour la détection de la tuberculose pulmonaire, les standards de référence étaient la culture et un standard de référence composite. Pour la résistance à la rifampicine, les standards de référence étaient les tests phénotypiques de sensibilité médicamenteuse basés sur la culture, avec ou sans séquençage du génome entier.
Recueil et analyse des données
Deux auteurs de revues ont indépendamment extrait les données à l'aide d'un formulaire standardisé. Nous avons évalué le risque de biais à l'aide de l’outil QUADAS-2. Nous avons réalisé des méta-analyses à l'aide d'un modèle bivarié afin d’estimer des sensibilités et spécificités combinées, séparément pour la détection de la tuberculose pulmonaire et la détection de la résistance à la rifampicine. Nous avons effectué des analyses de sous-groupes par statut du frottis d’expectoration, par statut VIH et selon les antécédents de tuberculose. Nous avons résumé les résultats de type «trace» obtenus avec le Xpert Ultra.
Résultats principaux
La détection de la tuberculose pulmonaire
Pour la détection de la tuberculose pulmonaire, la sensibilité combinée et la spécificité de Xpert Ultra par rapport à la culture étaient de 90,7 % (intervalle de confiance (IC) à 95 % de 88,2 à 92,7) et de 94,8 % (IC à 95 % de 92,8 à 96,3) (32 études, 12 529 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé). La plupart des études présentaient un faible risque de biais dans tous les domaines de l’outil QUADAS-2. Si les estimations ponctuelles pour Xpert Ultra sont appliquées à une cohorte hypothétique de 1 000 personnes, parmi lesquelles 100 personnes présentant des symptômes ont une tuberculose pulmonaire, Xpert Ultra manquera neuf cas. Le nombre de personnes diagnostiquées à tort avec une tuberculose pulmonaire serait de 47.
Chez les personnes vivant avec le VIH, la sensibilité combinée et la spécificité de Xpert Ultra étaient de 87,7 % (82,0 à 91,7) et de 95,3 % (92,2 à 97,2) (11 études, 1 164 participants). Chez les personnes atteintes de tuberculose pulmonaire à frottis d’expectoration négatif et culture positive, la sensibilité combinée et la spécificité de Xpert Ultra étaient de 80,7 % (75,4 à 85,0) et de 94,0 % (91,3 à 95,9) (16 études, 6 460 participants). Chez les personnes ayant des antécédents de tuberculose, la sensibilité combinée et la spécificité de Xpert Ultra étaient de 84,8 % (78,2 à 89,7) et de 86,2 % (78,9 à 91,3) (9 études, 809 participants).
La proportion de résultats de type « trace » avec l’Ultra qui correspondaient à de vrais positifs par rapport au standard de référence microbiologique était de 38,8 %. La reclassification des résultats de type « traces » en résultats négatifs de Xpert Ultra a entraîné une réduction de la sensibilité et une augmentation modeste de la spécificité.
La détection de la résistance à la rifampicine
Pour la détection de la résistance à la rifampicine, la sensibilité combinée et la spécificité de Xpert Ultra étaient de 95,8 % (93,2 à 97,4) et de 98,3 % (97,0 à 99,0) (10 études, 1 644 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé). La plupart des études présentaient un faible risque de biais dans tous les domaines de l’outil QUADAS-2. Si les estimations ponctuelles pour Xpert Ultra sont appliquées à une cohorte hypothétique de 1 000 personnes, parmi lesquelles 100 personnes présentant des symptômes ont une résistance à la rifampicine, Xpert Ultra manquera quatre cas. Le nombre de personnes diagnostiquées à tort avec une résistance à la rifampicine serait de 16 sur les 900 qui n'ont pas de résistance à la rifampicine. Xpert Ultra a obtenu des résultats similaires concernant la résistance à la rifampicine, chez les personnes atteintes de tuberculose à frottis d’expectoration positif et négatif.
Conclusions des auteurs
Xpert Ultra présente une sensibilité et une spécificité élevées pour la détection de la résistance à la rifampicine de la tuberculose pulmonaire. Dans la détection de la tuberculose pulmonaire, Xpert Ultra a une sensibilité plus faible chez les personnes à frottis d’expectoration négatif avec culture positive et une sensibilité et une spécificité plus faibles chez les personnes avec des antécédents de tuberculose. Les résultats de type « traces » de Xpert Ultra étaient fréquents.
Les qualités de cette revue sont l'approche adoptée pour identifier les études pertinentes, le nombre d'études et de participants inclus dans cette revue systématique, et le fait que la plupart des études présentaient un faible risque de biais. Le faible nombre d'études (six) et de participants adolescents constitue une limite à nos estimations de précision dans ce groupe d'âge.
Le test Xpert Ultra fournit des résultats précis et peut permettre l'instauration rapide d'un traitement contre la tuberculose résistante à la rifampicine et multirésistante.
Financement
L'OMS a soutenu cette revue systématique. La Liverpool School of Tropical Medicine a accueilli la base éditoriale du Cochrane Infectious Diseases Group (Maladies Infectieuses), qui a soutenu les auteurs dans l'élaboration de cette mise à jour de la revue. Le Foreign, Commonwealth and Development Office a financé le CIDG (Cochrane Infectious Diseases Group).
Enregistrement
Protocole générique disponible sur Open Science Framework via https://osf.io/26wg7/wiki/home/. Les versions précédentes du protocole et de la revue sont disponibles via DOI 10.1002/14651858.CD009593 et DOI 10.1002/14651858.CD009593.pub5.
Traduction et Post-édition réalisées par Cochrane France avec le soutien de Wenzhang Yu (bénévole de Cochrane France) et grâce au financement du Ministère de la Santé. Une erreur de traduction ou dans le texte original ? Merci d’adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr
