Invazivne gljivične infekcije značajan su problem kod imunokompromitirane djece, odnosno djece u koje imunološki sustav ne radi propisno. Većina takve djece imaju rak. Antifungalni lijekovi, odnosno lijekovi protiv gljiva, mogu se dati kada ta djeca razviju vrućicu (npr. vrućica koja se javlja kada su bijele stanice ili neutrofili niski tijekom kemoterapije) ili kada je infekcija formalno dijagnosticirana (kao kod kandidida, kandidijaze i invazivne aspergiloze). Antifungalni lijekovi koji su uspoređeni u okviru ovog Cochraneovog sustavnog pregleda izgledaju jednako djelotvorni. Prikupljanjem podataka iz nekoliko dostupnih studija ukazuje na to da su oštećenja bubrega bila manje vjerojatna primjene lipidnog amfotericina B u usporedbi s konvencionalnim amfotericinom B te se preporučuje primjena lipidnog amfotericina B ukoliko je moguće. Kod djece nisu zabilježene značajne razlike u usporedbi tijekom primjene drugih antifungalnih lijekova. Potrebne su dodatne studije u djece koje ocjenjuju primjenu dostupne antifungalne terapije kako bi se dodatno razjasnile bilo kakve prednosti s obzirom na smrtni rizik, izgledi potpunog oporavka i toksičnosti lijekova.