Azatioprin i 6-merkaptopurin su imunosupresivni lijekovi za koje se smatra da smanjuju upalu blokiranjem imunosnog sustava. Ovaj Cochraneov sustavni pregled literature uključuje 13 randomiziranih kontroliranih istraživanja u kojima je sudjelovalo ukupno 1,211 ispitanika. Rezultati tih istraživanja pokazuju da su azatioprin i 6-merkaptopurin vjerojatno učinkovitiji od placeba (lažni lijek) za postizanje remisije u Crohnovoj bolesti. Dokazi pokazuju da je kombinacija azatioprina i infliksimaba bolja od samog infliksimaba za postizanje remisije u aktivnoj Crohnovoj bolesti, koja ne zahtijeva uzimanje steroida. Lijekovi koji blokiraju tumorski čimbenik nekroze alfa (engl. tumor necrosis factor, TNF), kao što je infliksimab, mogu biti druga mogućnost liječenja za pacijente koji ne odgovaraju na liječenje kortikosteroidima ili imunosupresivima. Azatioprin i 6-merkaptopurin mogu smanjiti potrebu za liječenjem steroidima i njihova uporaba može smanjiti učestalost nuspojava povezanih s uzimanjem steroida. Međutim, ti lijekovi sporo djeluju i povezani su s određenim rijetkim, ali ozbiljnim nuspojavama. U nekih pacijenata potiskuju stvaranje krvnih stanica koje se bore protiv infekcije, potiču zgrušavanje krvi i povremeno uzrokuju upalu gušterače (pankreatitis). Ti su lijekovi također povezani s povećanim rizikom od limfoma. Stoga je nužno detaljno razmotriti upotrebu tih lijekova u pacijenata s aktivnom Crohnovom bolešću.