Kad bebe nisu isključivo dojene majčinim mlijekom, dokazi kažu da korištenje formule na bazi soje umjesto kravlje formule mlijeka ne smanjuje alergije kod dojenčadi i djece. Formule za dojenčad su pripremljene na poseban način kako bi se pokušale smanjiti mogućnosti razvoja alergije ili intolerancije na hranu. Te formule uključuju hidrolizirano kravlje mlijeko i sojine formule. Ovaj Cochrane sustavni pregled istraživanja dojenčadi koja nisu u potpunosti dojena, a koja imaju veći rizik za razvoj alergija, pokazuje da nema smanjenja alergija u kasnijem djetinjstvu povezanog s prehranom soja formulom u usporedbi s formulom kravljeg mlijeka. Nisu pronađena odgovarajuća istraživanja koja uspoređuju soju s hidroliziranom proteinskom formulom.