지속성 설사는 14일 이상 지속되는 급성 설사 증상으로, 전세계 개발 도상국의 5세 미만의 소아에게서 이환율 및 사망률의 중요한 원인이 되고 있다. 지속성 설사의 원인은 완전히 밝혀지지 않았지만 이는 복잡할 가능성이 높다. 결과적으로, 질환의 관리가 어렵다. 프로바이오틱스는 건강한 사람의 장내에 정착하고 있는 정상 세균과 유사한 세균 및 효모이다. 몇 건의 연구에서 이러한 '몸에 좋은' 세균은 급성 감염성 설사를 치료하고 결과를 촉진하기 위해 여러 연구에서 사용되고 있다. 본 고찰에서는 지속성 설사 소아를 대상으로 한 4건의 임상시험이 확인되었다. 총 324명의 참가자를 대상으로 한 2건의 연구에서는 프로바이오틱스는 5일째에 설사의 지속 기간을 단축시키고, 또한 배변 횟수를 감소시키는 것으로 나타났다. 1건의 연구(235명의 소아)에서는 프로바이오틱스가 입원 일수를 줄일 수 있다는 것이 제시되었다. 4건의 임상시험 중 3건에서 부작용이 발생하지 않은 것으로 보고되었다. 그러나 본 고찰은 소수의 참가자를 대상으로 한 몇 건의 임상시험에 따른 제한적 검토였기 때문에, 프로바이오틱스의 효과에 대한 믿을 수 있는 추정치를 보여주는 것이 아닐 수도 있다.